首創的數據庫——基於超過54,000名UK Biobank志願參與者的樣本——為未來發現新藥物靶點奠定了基礎。
《Nature》期刊發表了一項研究成果,這是全球範圍內最大規模且最全面的研究,探討了常見遺傳變異對血液中循環蛋白質的影響,以及這些蛋白質如何與疾病相關聯。這項研究利用UK Biobank的生物樣本轉化成的數據,將有助於科學家更好地理解疾病的發展機制,並可能推動新的診斷方法和治療手段的開發,這些手段將適用於多種健康狀況。
研究人員開發了這一獨特的數據庫,他們從UK Biobank的54,000多名參與者中測量了近3,000種循環蛋白質的數量,其中許多蛋白質以前很難測量。該研究發現了超過14,000個常見遺傳變異與血液中蛋白質之間的關聯,其中超過80%是之前未知的。全球的科學家將能在未來幾周通過UK Biobank獲取這些蛋白質組數據。
這項具有里程碑意義的研究是由Pharma Proteomics Project委託、資助和執行的,該項目是13家領先生物製藥公司的合作。該團隊對數據進行了分析,證明了利用這項研究進行未來研究的巨大潛力。這些研究包括進行全基因組關聯研究,建立一個開放存取的資料庫,收錄所有影響血液中蛋白質水平的常見基因變異。這將有助於研究複雜的生物過程,找到導致疾病的關鍵蛋白質,識別新的藥物靶點,並可能縮短早期藥物候選物的開發時間,提高臨床試驗的成功率。
此外,研究還分析了UK Biobank中前20種最常見健康狀況的血液蛋白質水平,發現例如長期被認為會導致心理健康問題的炎症蛋白質,在患有抑鬱症的患者中顯著較高。研究還利用機器學習模型來確定血液蛋白質如何成功預測人口統計因素,發現血液蛋白質可以非常準確地預測年齡、性別和體質指數(BMI)。未來,這項技術可以用來比較生物年齡與實際年齡,並確定這與未來疾病風險的關聯。
UK Biobank的首席科學家Naomi Allen教授表示:“這項重大的研究為生物醫學社區提供了全新的研究途徑,是跨部門合作能夠取得遠大於各自部分總和的成果的典範。所有這些數據將很快對全球的合格研究人員開放,與UK Biobank為其50萬志願者所持有的現有基因組、生活方式和健康數據一起。我對研究人員使用這些數據來識別模式,這些模式可能會改變我們對疾病發展方式的理解,並識別潛在的新治療途徑感到興奮。”
Janssen Research & Development, LLC的神經科學、數據科學與數字健康部門主任,Pharma Proteomics Project的領導者Chris Whelan博士表示:“到目前為止,科學界在基因組學上的投資大幅推進了精準醫療的發展。然而,要在正確的時間為正確的患者識別正確的藥物,我們必須超越單純的基因組學。這個數據庫將幫助描繪出一幅更細緻、更詳盡的圖景,展示人類基因組和血液中循環的蛋白質如何影響人類健康和疾病——使生物醫學研究人員能夠識別新的生物學關聯,找到新的藥物靶點,並建立基於血液的診斷方法。”
預期這項研究將帶來的其他創新工作包括使用血液中循環的蛋白質來預測某人是否會在疾病發生前幾年發展出疾病,將疾病分類為不同的生物學亞型,以及使用血液中的蛋白質來預測臨床試驗前藥物的功效和安全性。
藥物蛋白質體學計畫的生物製藥公司:Alnylam, Amgen, AstraZeneca, Biogen, Bristol Myers Squibb, Calico, Genentech, a member of the Roche Group, GSK, The Janssen Pharmaceutical Companies of Johnson & Johnson, Novo Nordisk, Pfizer, Regeneron and Takeda.
UK Biobank樣本庫中 20 種最常見的健康狀況:
· Disorders of lipoprotein metabolism and other lipidaemias
· Depression
· Essential (primary) hypertension
· Chronic ischemic heart disease
· Acute upper respiratory infections
· Unspecified acute lower respiratory infection
· Vasomotor and allergic rhinitis
· Asthma
· Gastro-oesophageal reflux disease
· Gastritis and duodenitis
· Diaphragmatic hernia
· Diverticular disease of intestine
· Other diseases of anus and rectum
· Other dermatitis
· Other disorders of skin and subcutaneous tissue
· Other arthrosis
· Other joint disorders
· Dorsalgia
· Other soft tissue disorders
· Other disorders of urinary system
資料、圖片來源:https://www.nature.com/articles/s41586-023-06592-6
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